Vegyi anyagként a fertőtlenítőszerek tárolási helyükön különös figyelmet igényelnek. Általánosságban elmondható, hogy a fertőtlenítőszereket jól szellőző, száraz helyen, közvetlen napfénytől és gyermekektől távol kell tárolni, például hűvös, száraz helyen, például tárolóhelyiségben, szekrényben vagy dobozban. Továbbá élelmiszerektől és italoktól távol kell tartani a véletlen lenyelés vagy visszaélés elkerülése érdekében. Ha a fertőtlenítőszer folyékony, akkor a szivárgás elkerülése érdekében zárt edényben kell tárolni. Tároláskor a balesetek elkerülése érdekében más vegyszerektől elkülönítve kell tartani.
